Kou Yamori personifica o estudante mediano: notas razoáveis, popularidade superficial e um esforço constante para manter as aparências. Cansado da rotina escolar e da vida que leva, decide abandonar tudo, mergulhando em noites em claro e uma crescente insônia. As ruas noturnas se tornam seu refúgio, um lugar onde a solidão paradoxalmente o acalma, mesmo sabendo que sua condição é preocupante.

No Japão, a rotina é interrompida pela emergência constante de Kaiju, criaturas colossais que representam uma ameaça implacável à existência humana. Em meio ao caos, Kafka Hibino nutre um sonho audacioso: alistar-se na Força de Defesa e lutar na linha de frente contra esses monstros. Unindo forças com sua amiga de infância, Mina Ashiro, ele faz uma promessa solene de que juntos protegerão o país.

Momo Ayase é uma estudante um tanto particular. Ela mora com sua “avozinha” que trabalha como médium e a criou com a crença de que espíritos e demônios não são apenas fruto da imaginação. Um dia ela conhece e ajuda Ken, um colega de escola que é marginalizado e intimidado por seus colegas porque ele está convicto da existência de alienígenas. Os dois, que a princípio não acreditam ter muito em comum, se desafiam para provar a existência de suas crenças sobrenaturais e, de repente, se veem envolvidos em uma guerra entre facções de criaturas ocultas de proporções planetárias! Eles serão capazes de sobreviver entre demônios, alienígenas e colegas de escola muito únicos?!"